أنشأتها شجر الدر زوجة السلطان الأيوبي الصالح نجم الدين أيوب، وذلك عام 640هـ/ 1241م، وتقع خلف مشهد السيدة نفيسة داخل حوش الخلفاء العباسيين بقرافة السيدة نفيسة بحي الخليفة بمدينة القاهرة، وتلاصق هذه القبة جامع السيدة نفيسة من الناحية الجنوبية الغربية، وكان هذا الحوش يعرف في العصر الفاطمي بتربة بني الم

ينسب هذا الجامع إلى الخليفة الفاطمي الحاكم بأمر الله، مع أن والده الخليفة العزيز بالله هو الذي أمر بإنشائه سنة 380هـ/ 990م، وقبل أن يكتمل بناؤه صليت فيه الجمعة في الثالث من شهر رمضان سنة 381هـ/ 991م، ولما خلف الحاكم والده أمر بإتمام بنائه. ويقع الجامع في أول شارع المعز لدين الله ملاصقًا لباب الفتوح