المسجد الحالي أنشأه الخديو عباس حلمي الثاني باشا أحد حكام عصر أسرة محمد علي، سنة 1314هـ/ 1896م، ويقع في شارع الأشراف امتداد شارع الخليفة بميدان السيدة نفيسة حي الخليفة بمدينة القاهرة، ويقال أن أول من بنى على قبر السيدة نفيسة الوالي العباسي عبيد الله بن السرى بن الحكم من عام 206هـ/ 822م حتى عام 209هـ
أنشأ هذه الخانقاة الأمير شيخو أحد أمراء عصر الناصر محمد بن قلاوون وأولاده، وذلك عام 756هـ/ 1355م، وتقع في شارع شيخون بحي الخليفة بمدينة القاهرة، ومكان الخانقاة؛ التي تطل على شارع شيخون بالصليبة؛ كان جزءاً من مدينة القطائع عاصمة الطولونيين، وكانت مساكن إشتراها الأمير شيخو من أصحابها وهدمها، وكانت مسا